生活在京都的天童纯是个不太有自信的十五岁男孩。父亲七年前死于事故，此后纯一直和母亲两个人过日子。这天，纯在放学回家的路上被神秘魔物追赶，危急之中逃入一所古寺，僧人源云救了他。谁知纯就此被带往时空的彼方